Первая версия программы "Контур-Бухгалтерия" создавалась в 2003 г. по заказу Екатеринбургского трамвайно-троллейбусного управления. Новый программный продукт обладал беспрецедентной мощностью, обрабатывая большие объемы информации и обеспечивая одновременную работу 120 пользователей. Оценив достигнутые результаты, руководство компании СКБ Контур приняло решение и дальше развивать программу до уровня самостоятельного программного продукта для автоматизации бухгалтерского учета. В 2005 г. под названием "Контур-Бухгалтерия Актив" программа включена в состав продуктовой линейки тиражных решений СКБ Контур наряду с такими известными продуктами, как "Контур-Экстерн", "Контур-Персонал", "Контур-ЖКХ" и др. Федеральный IT-разработчик СКБ Контур производит выпуск обновлений программы "Контур-Бухгалтерия" 3-4 раза в год. Начиная с версии 1.5., в русле корпоративной политики унификации названий продуктовых брендов программа "Контур-Бухгалтерия Актив" переименована в "Контур-Бухгалтерию".
В версии 1.5 программы "Контур-Бухгалтерия" в основу ведения автоматизированного налогового учета положены те же принципы, которые используются в бухгалтерском учете. Теперь бухгалтерские и налоговые суммы учитываются одними и теми же проводками. Для налоговых сумм применяются способы калькуляции, принятые в бухгалтерском учете. В бухгалтерском и налоговом учете используется единый план счетов. Для настройки налогового учета в плане счетов введен специальный признак, который включает поддержку налогового учета для тех счетов, которые используются в учете активов предприятия, доходов и расходов, как в бухгалтерском, так и в налоговом учете. Предусмотрена настройка для случаев, когда порядок принятия к учету одних и тех же операций в бухгалтерском и налоговом учете различаются. В процессе налогового учета хозяйственных операций осуществляется их автоматическая классификация по статьям доходов и расходов в соответствии с 25-й главой НК РФ. Налоговые регистры представлены в упрощенном варианте.
Сегодня среднее время внедрения базовой конфигурации программы "Контур-Бухгалтерия" составляет от одной до трех недель. При необходимости специалисты СКБ Контур обеспечивают доработку базовой версии с учетом индивидуальных потребностей клиентов, вносят клиентские данные, осуществляют предварительную настройку программы, обучают персонал, а также сопровождают клиента до сдачи первого баланса в ближайшем отчетном периоде. Дальнейшая пользовательская поддержка программы "Контур-Бухгалтерия" осуществляется сервисными структурами СКБ Контур через телефонную горячую линию.